在这段时间，拿破仑没有服用过药物，直到几个月后，他的健康日渐恶化，食欲减退，胃痛，呕吐不止，而且吐出咖啡状呕吐物，和排除漆黑粪便(melaena)，这两者都是胃出血的临床症状。


　　便秘日益严重，拿破仑才开始接受派来的安东马齐医生(Antonmarchi)的治疗，最终因肠胃出血，精神错乱，陷入昏迷状态，奄奄一息而逝。


　　拿破仑患上末期胃癌


　　根据记录，拿破仑在弥留时还吩咐安东马齐医生解剖他的尸体，详细检查他的胃部，然后将报告交给他儿子，告诉他应该要有怎样的生活方式，以及寻求办法来预防患上同样的病患。


　　拿破仑一直怀疑他的病有家族遗传，他的父亲就因肝脏硬化而死。一位皇帝竟然吩咐别人剖解自己的尸体，别说是皇帝，就算平民百姓，也不会这样做，这也是拿破仑与众不同的地方。

后来(1938年)的研究发现，他的父亲死于胃癌。