后来，在中国共产党十一届六中全会通过的《关于建国以来党的若干历史问题的决议》，对九大作了这样的评价：


　　“党的九大使‘文化大革命’的错误理论和实践合法化，加强了林彪、江青、康生等人在党中央的地位。九大在思想上、政治上和组织上的指导方针都是错误的。”


　　1971年9月12日晚，在北京人民大会堂福建厅里召开的中央会议，实际上已经陷于停顿。主持会议的周恩来总理，已经把注意力放到了林彪身上。


　　1971年8月中旬，毛泽东离开北京乘火车去南方视察。他每到一个省、市都要找党政军负责人谈话，几次谈了九届二中全会的斗争问题，点名批评林彪、陈伯达和黄永胜等人。


　　毛泽东还不点名地批评了林立果：“二十几岁的人就捧为超天才，这没有什么好处。”


　　毛泽东重申了“三要三不要”的观点：“希望你们要搞马列主义，不要搞修正主义；要团结，不要分裂；要光明正大，不要搞阴谋诡计。”